Após a criação do Programa de Atenção à Saúde da Pessoa com Deficiência pelo Ministério da Saúde (MS) em 1991, que visava a redução da incidência de deficiências no país e a garantia de atenção integral na rede de serviços do SUS, a SESAB instituiu o Programa de Prevenção e Assistência às Deficiências no Estado da Bahia (PROPAD) em 1992. Após um período de trabalho deste programa, iniciaram-se as discussões sobre a necessidade de criação de um centro de reabilitação público e estadual para a pessoa com deficiência, com a reabilitação pautada no embasamento teórico preconizado pelo ministério da saúde e os princípios e diretrizes do SUS.
Em janeiro de 1999, o Centro Estadual de Prevenção e Reabilitação Da Pessoa com Deficiência – CEPRED é criado pela Resolução nº 1498 do Conselho Estadual de Saúde (CES) e inicia suas atividades como Unidade Gestora através da Portaria nº 849/1999, funcionando no centro de reabilitação profissional do INSS no bairro de Brotas, em Salvador.
Com o desenvolvimento das atividades e modificações da estrutura organizacional e nos processos de trabalho, paralelo ao aumento substancial da demanda de usuários, a instituição foi transferida no ano de 2002 para o prédio do Centro de Atenção à Saúde (CAS), no bairro Parque Bela Vista em Salvador, onde se encontra até os dias atuais.
Atualmente, está credenciada como Centro Especializado em Reabilitação – CER III, de acordo com a Portaria MS/793, de 24 de abril de 2012, compondo a Rede de Cuidados à Pessoa com Deficiência do Estado da Bahia e é campo de estágio, estudos e pesquisas científicas, além de realizar treinamentos em serviço para outras unidades da Rede de Atenção à Saúde (RAS), propiciando trocas de experiências e qualificação da assistência.
Desde a sua criação, o Cepred compreende que a deficiência não consiste em mera questão de saúde, mas tem relação com o meio ambiente e as atitudes da comunidade e família diante da pessoa com deficiência. A instituição tem como objetivo prestar assistência à população do estado da Bahia, na área de prevenção secundária, habilitação e reabilitação, fundamentada na atenção integral, no enfoque interdisciplinar, no protagonismo do usuário e da família e na melhoria da qualidade de vida, visando possibilitar que a pessoa com deficiência alcance um melhor desempenho intelectual, funcional e social.

Primeira sede do Cepred, localizada no prédio do INSS, no bairro de Brotas.

Sede atual do CEPRED, localizada no Centro de Atenção à Saúde (CAS), Parque Bela Vista.